Acuerdos de cooperación de Vet-LIRN
Oportunidades financiadas actualmente
Programa de subsidios de infraestructura de red Vet-LIRN (U18) (en inglés)
La financiación de la infraestructura es clave para garantizar que la red funcione y que los laboratorios trabajen con el propósito de respaldar la misión de Red de investigación y respuesta de laboratorios veterinarios (Vet-LIRN, por sus siglas en inglés). Estas ayudas facilitan la participación en actividades de Vet-LIRN tales como respuesta a quejas de consumidores, ejercicios de emergencia, ejercicios de aptitud y acreditación de laboratorios. Además, los acuerdos aumentan la capacidad de la agencia para analizar una mayor cantidad de muestras en caso de enfermedades relacionadas con alimentos o medicamentos para animales u otros eventos de emergencia a gran escala que requieran más pruebas de muestras de alimentos para animales o diagnósticos implicados. Por otra parte, los acuerdos cooperativos permiten que los laboratorios de la red soliciten fondos adicionales si están participando en un proyecto Vet-LIRN específico, como el programa de monitoreo de resistencia a los antimicrobianos (AMR, por sus siglas en inglés), o si están realizando un trabajo de secuenciación del genoma completo (WGS, por sus siglas en inglés), o hasta si su número de casos es particularmente pesado.
Proyectos del desarrollo de capacidades de la red Vet-LIRN (U18) (en inglés)
El acuerdo cooperativo está destinado a apoyar proyectos o subsidios de equipos para ayudar a investigar posibles problemas con los alimentos de origen animal, así como apoyar el trabajo relacionado con la resistencia a los antimicrobianos y el manejo de antimicrobianos. Los laboratorios Vet-LIRN pueden solicitar financiamiento para investigaciones relacionadas con problemas emergentes de inocuidad de los alimentos públicos identificados por Vet-LIRN, al igual que para el equipo y el personal necesarios para ampliar la capacidad de los laboratorios. Este trabajo puede incluir el desarrollo y validación de nuevos métodos o trabajo para apoyar los esfuerzos relacionados con la resistencia a los antimicrobianos o el manejo de antimicrobianos. Los laboratorios que estén trabajando para desarrollar y validar nuevos métodos pueden participar en el programa de prueba de método a ciegas de Vet-LIRN.
De 2021 a 2024, se agregó un Aviso de interés especial (en inglés) a este anuncio para la petición de aplicaciones relacionadas con el trabajo de diagnóstico animal de COVID-19. A continuación se proporciona más información relacionada con las actividades de Vet-LIRN de COVID-19.
Prueba de método a ciegas
Las pruebas de muestras de diagnóstico animal permiten que Vet-LIRN aborde completamente las quejas de los consumidores sobre alimentos o medicamentos para animales. Los subsidios del Desarrollo de capacidades y las Pruebas de métodos a ciegas aseguran que los métodos de prueba utilizados en los laboratorios de la red hayan sido evaluados adecuadamente y que proporcionen datos confiables. Aunque los métodos de Vet-LIRN no son métodos regulatorios, las Pautas de validación de métodos de la FDA (en inglés) son generalmente seguidas durante el desarrollo y la evaluación del método. La mayoría de los proyectos tienen las siguientes fases (vea Figura 1):
- Laboratorio que origina el método (MO, por sus siglas en inglés) – Recipiente del subsidio del acuerdo de cooperación
- Desarrollo/optimización del método.
- Validación interna utilizando muestras no ciegas.
- Vet-LIRN
- Vet-LIRN evalúa el desempeño del método en el laboratorio MO a través de ejercicios denominados Pruebas de métodos a ciegas (BMTs, por sus siglas en inglés). Vet-LIRN prepara y envía las muestras al laboratorio MO para un análisis ciego (es decir, imparcial). El laboratorio MO analiza las muestras ciegas y envía los resultados a los organizadores para la evaluación del desempeño.
- Laboratorio MO
- Se comparte el método con otros laboratorios colaboradores Vet-LIRN.
- Vet-LIRN
- Vet-LIRN evalúa el rendimiento del método en múltiples laboratorios en una Prueba de método a ciegas.
Los métodos desarrollados por nuestros laboratorios Vet-LIRN son evaluados extensamente y serán
- compartidos con otros a través del portal de depósito de datos (www. protocols.io) (en inglés), publicados en una revista científica, y
- adoptados y utilizados por los laboratorios Vet-LIRN para sus fines de diagnóstico animal de rutina y quejas de consumidores de CVM.
Figura 1. ¿Cuáles son los pasos de una prueba de método a ciegas?
Los métodos destacados que completaron los BMTs 2020-2023 incluyen:
- Universidad de Illinois – Se completó el BMT de un solo laboratorio para evaluar el uso del método de agrupación de muestras para detectar el SARS-CoV-2 mediante q-RT-PCR en biomatriz animal. Este BMT proporcionó evidencia de que esta agrupación es un método efectivo para detectar el SARS-CoV-2 en la matriz fecal felina.
- Universidad de Illinois – Se evaluó el uso de amplificación isotérmica mediada por bucle (Loop-mediated isothermal amplification o LAMP, por sus siglas en inglés) como método confiable para la detección de SARS-CoV-2 en matriz fecal felina. Se completó el BMT de un solo laboratorio para evaluar el desempeño del procedimiento en el laboratorio de origen.
- Universidad de Pensilvania – Se evaluó el uso de LAMP como método confiable para la detección de SARS-CoV-2 en lavado endotraqueal canino. Se completó el BMT de un solo laboratorio para evaluar el desempeño del procedimiento en el laboratorio de origen.
- Universidad Estatal de Dakota del Norte – Detección de SARS-CoV-2 en hisopos nasales y homogeneizados de pulmón de gatos y perros. Se completó el BMT de un solo laboratorio para evaluar el desempeño del procedimiento en el laboratorio de origen.
- Universidad de California Davis – Determinación cuantitativa del pesticida “Compuesto 1080” en riñón bovino mediante LC-MS/MS. El compuesto 1080 (monofluoroacetato de sodio) es un compuesto de toxicidad aguda que se utiliza para el control de roedores y depredadores. Es artificial y se encuentra naturalmente en algunas plantas tropicales. Ocurre el envenenamiento accidental de animales no objetivo, y es importante desarrollar pruebas de diagnóstico para confirmar la exposición. El método se evaluó con éxito durante el BMT de un solo laboratorio en el laboratorio de origen.
- Universidad de Pensilvania – Cuantificación de aflatoxina B1 en alimentos para peces mediante un procedimiento de flujo lateral, que se basa en el sistema CHARM. El moho puede producir aflatoxina B1 en ingredientes alimentarios como cereales (por ejemplo, maíz, trigo, cebada), arroz, nueces y frutas. La aflatoxina B1 es la aflatoxina más tóxica y es conocida por su impacto mutagénico, carcinogénico, teratogénico e inmunosupresor. Puede causar la muerte o intoxicación en los peces, lo que resulta en una tasa de crecimiento reducida e inmunosupresión. Por lo tanto, son deseables métodos rápidos para identificar este tóxico en los alimentos para peces. El método se evaluó en BMTs de un solo laboratorio y de varios laboratorios. En ambos BMTs, las muestras fueron preparadas por Vet-LIRN y analizadas en cuatro laboratorios colaboradores.
- Universidad Estatal de Kansas – Cuantificación del marcador de irradiación 2-DCB en pollo deshidratado usando GC-MS. Algunos fabricantes irradian alimentos para mascotas para matar patógenos bacterianos y virales y prolongar la vida útil de los alimentos. Sin embargo, la irradiación inadecuada de alimentos puede provocar la contaminación microbiana de los productos alimenticios. Por lo tanto, es importante tener un método eficaz para determinar la dosis de irradiación para determinar si los alimentos se irradian adecuadamente.
Respuesta destacada de Vet-LIRN de COVID-19
Vet-LIRN apoyó la capacidad y la respuesta de emergencia relacionada con COVID-19. Vet-LIRN financió laboratorios a través del mecanismo de los Subsidios del desarrollo de capacidades. De 2021 a 2023, se financiaron 21 acuerdos de cooperación de COVID-19 en 19 laboratorios. Estos acuerdos respaldaron el desarrollo y la validación de múltiples métodos incluidos ELISA, Secuenciación de próxima generación, múltiples plex q-RT-PCR, junto con otros. Los esfuerzos combinados de los laboratorios que recibieron subsidios de la PAC COVID-19 permitieron examinar más de 7,000 muestras e identificar nuevas especies susceptibles. Los protocolos publicados se pueden encontrar en el espacio de trabajo de Vet-LIRN Protocols.IO (en inglés). Los esfuerzos de Vet-LIRN relacionados con COVID-19 se centraron en la respuesta de emergencia, al mismo tiempo que promovían y protegían la salud humana y animal. Los laboratorios de diagnóstico veterinario desarrollaron capacidad de laboratorio, capacitaron a científicos y brindaron información científica crítica a las partes interesadas federales. Vet-LIRN se centró en garantizar que los resultados recopilados por los laboratorios de la red sean precisos y significativos para mejorar nuestra capacidad de responder a la pandemia.
- Vet-LIRN ofreció tres Ejercicios de comparación entre laboratorios (ICE, por sus siglas en inglés) para evaluar los procedimientos de detección de SARS-CoV-2 en laboratorios de diagnóstico veterinario. Los ejercicios se realizaron en colaboración con los académicos, la industria privada y laboratorios socios del gobierno, incluyen la Red Nacional de Laboratorios de Salud Animal (NAHLN, por sus siglas en inglés) del USDA, el Campus de Prueba de Competencia del Centro Moffett de la FDA/CFSAN, la Universidad de Cornell, el Servicio Geológico de los Estados Unidos (USGS, por sus siglas en ingles) y el Consorcio Integrado de Redes de Laboratorios (ICLN, por sus siglas en ingles).
- ICE 1: Comparación entre laboratorios de procedimientos de detección molecular de SARS-CoV2 utilizados por laboratorios de diagnóstico veterinario de EE. UU. (en inglés)
- ICE 2: Segunda ronda de una comparación entre laboratorios de procedimientos de detección molecular de SARS-CoV2 utilizados por 45 laboratorios de diagnóstico veterinario en los Estados Unidos (en inglés)
- ICE 3: Detección exitosa de variantes Delta y Omicron del SARS-CoV-2 por participantes de laboratorios de diagnóstico veterinario en un Ejercicio de comparación entre laboratorios (en inglés)
- Vet-LIRN trabajó en colaboración para realizar una prueba de competencia (PT, por sus siglas en inglés) para la detección de la variante Omicron del SARS-CoV2 en un Medio de transporte molecular (MTM, por sus siglas en inglés) y en una matriz de desafío de homogeneizado fecal felino. Treinta y dos participantes utilizaron sus métodos de PCR internos para evaluar la presencia de SARS-CoV-2 en MTM o muestras de homogeneizado fecal felino. Los resultados de los datos de PT revelaron que los participantes pueden detectar de manera confiable el SARS-CoV-2 en muestras de MTM. Las muestras fecales se clasificaron como muestras exploratorias, sin embargo, la mayoría de los participantes detectaron con éxito niveles elevados de SARS-CoV-2 en heces. Los resultados de este PT se utilizaron para dar retroalimentación a los participantes sobre su desempeño.